Genome Boxシリーズは、gBrowseをベースに改良を加え、高速シーケンサからの大量データであっても、快適に操作できるゲノムブラウザシステムです。
OSおよびゲノムブラウザをセットアップした状態でご提供しますので、煩雑なセットアップが不要です。
Genome Boxは小型PC、Genome BlockはブータブルUSB HDD、Genome StickはブータブルUSBメモリでご提供致します。
ここが便利!!
- ウェブブラウザ上での簡単操作でデータとアノテーションを閲覧できます。
- 自分の解析結果を公共アノテーションと一緒に表示し、任意の領域や、任意のリード・遺伝子等にコメント・タグを付与できます。
- コメント・タグの検索機能により、データ整理に最適です。
活用事例
- 高速シーケンスデータのマッピングおよび大腸菌株間のゲノム比較
Genome Box上で複数の大腸菌株のゲノムシーケンスデータをマッピングし、マップ結果を菌株間で比較した活用事例です。
- エクソンキャプチャサンプルの高速シーケンスデータによるヒト多型の人種間比較
Genome Box上で複数人種のエクソンキャプチャシーケンスデータをマッピングおよび、多型コールを実施し、人種間で比較した活用事例です。
- トランスクリプトーム(RNA-Seq)解析による組織特異的スプライスバリアント推定
異なる組織由来のRNA-Seqデータのマッピング、可視化を通して、組織特異的に発現しているスプライスバリアント、新規エクソン候補領域を確認した活用事例です。
- クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)解析によるヒト転写調節領域の探索
複数の転写因子のChIP-Seqデータのマッピング、可視化を通して、転写因子結合候補領域の探索をした活用事例です。
- Bacteria Genome 配列の可視化と活用
NCBIに登録されているBacteria Genome配列をGenome Boxに登録し、経時変化を追ったRNA-Seq解析結果をマッピング、可視化をした活用事例です。