主な機能
データ閲覧
ゲノムブラウザ上で大量シーケンスデータの解析結果（ゲノム再シーケンス、多型解析、遺伝子発現、ChIP-Seq、メチレーション解析等）を様々な形状（例：リードアライメント表示、リードdepthのグラフ／密度表示、多型のグラフ／密度／個別表示、ペアリードのダンベル表示など）で閲覧できます。（※1）
公共アノテーションを組み込んでご提供しますので、解析結果と比較しながらの閲覧が可能です。（※2）
データインポート
他の解析ソフトウェアからの出力データを取り込むことが可能です。（※1、3）
対応形式：SAM/BAM、GFF3、VCF、BedGraph
コメント追加
ゲノムブラウザ上で、任意の領域・項目（遺伝子などの公共アノテーション／解析結果データ）に対してコメントを追加できます。コメント文字列の検索も可能です。
ユーザ定義タグ追加／分類
ウェブブラウザからの操作で、任意の公共アノテーション・コメントにタグを追加することができます。
独自のタグが定義可能で、描画形状を指定しておくと、ゲノムブラウザ上で形状が反映されます。
タグを検索することができるので、後々のデータ整理が効率的に実施できます。
Workbench Mini：簡易解析機能（Genome Boxのみ）
Genome Boxでは、少量のfastq形式データのマッピングおよび、多型解析、タグカウントの簡易解析機能（Workbench Mini）が搭載されています
解析結果はゲノムブラウザにインポートし閲覧することが可能です。
※1 追加可能な解析結果データ量はディスク／USBメモリ容量に依存します。
※2 公共アノテーション付で提供可能な生物種／ビルドは随時追加予定。お急ぎ／未公開生物種の場合にはカスタマイズによるご提供も可能です。
※3 リファレンスゲノムデータが一致している場合に限ります。全ての解析ソフトウェアからの出力データ取り込みを保証するものではございません。
製品構成と主要機能
| 機能 | Genome Box | Genome Block | Genome Stick |
|---|---|---|---|
| ゲノムブラウザ | |||
| ゲノムブラウジング | ○ | ○ | ○ |
| コメント・タグの追加・検索 | ○ | ○ | ○ |
| プロジェクト管理機能 | |||
| プロジェクトの追加・削除 | ○ | ○ | ○ |
| トラックの追加・削除 | ○ | ○ | ○ |
| ユーザ管理 | ○ | ○ | ○ |
| 簡易解析機能 | |||
| マッピング | ○ | × | × |
| 多型探索 | ○ | × | × |
| タグカウント | ○ | × | × |
※記載の内容はすべて2011年12月現在のものであり、変更される場合があります。（製品の価格についてはお問い合わせください。）/製品の仕様・外観は予告なく変更される場合があります。
